Historia opowiedziana w grze rozpoczyna się 10 lat po wydarzeniach znanych z pierwszej odsłony Risen. Bezimienny, doświadczony przez los, coraz częściej topi smutki w alkoholu. Pewnego dnia odnajduje go Patty, córka legendarnego pirata Stalowobrodego. Dziewczyna trafiła na trop artefaktu, który mógłby okazać się pomocny w walce z, poczynającymi sobie coraz śmielej, tytanami. Potrzebuje jednak pomocy w odnalezieniu magicznego przedmiotu. Nadarza się ku temu dobra okazja, gdyż Bezimienny dostaje zlecenie od Inkwizycji sprawdzenia pirackiej frakcji na wyspie Puerto Sacarico. Od tego śledztwa zaczyna się przygoda.
